Alice se trezește din nou în Țara Minunilor, însă de data aceasta trebuie să călătorească printr-o lume complet nouă şi misterioasă pentru a intra în posesia unui sceptru fermecat cu ajutorul căruia să îl oprească pe maleficul Lord al Timpului înainte ca acesta să întoarcă ceasul înainte şi să transforme minunata Ţară a Minunilor într-un tărâm pustiu şi lipsit de orice formă de viaţă. Şi de parcă n-ar fi de ajuns, Alice mai trebuie să călătorească şi în timp pentru a-l salva pe prietenul ei, Pălărierul cel Nebun, şi să demaşte un plan malefic pentru a o urca pe Regina de Inimă înapoi pe tronul care i se cuvine de drept.